직원야근과 직원 보상체계 어떻게 하시는지요..

안녕하세요. 작년에 급성장 하면서 15명 정도의 직원을 가지고 회사를 운영중에 있습니다. 그동안은 전직원 모두 인센티브를 주기도 했고...직원들의 야근이 거의 없었는데요.. 최근 1~2개월 사이에 직원들이 자꾸 야근을 합니다. 저는 야근 수당을 떠나서 직원들의 삶의 질때문에 야근을 되도록 하지 않을것을 권고 하고 그래서 금욜은 1시간 일찍 퇴근 하는 제도도 두고 있습니다. 근데 어제 야근을 한다고 저녁식사를 위한 카드를 받아가고 야근을 한다는 시간을 보니 (회사내에 여러 사정상 cctv를 두고 있습니다. ) 6시 30분이 퇴근시간인데 7시 30~40분까지 일을 하고 , 그 시간부터 2시간 정도의 식사시간을 가지고 마무리를 한후 10시쯤에 퇴근을 합니다. 오너의 입장에서는 고작 1시간 야근을 하고 10시에 가까운 시간에 퇴근 카드를 찍는다 는게 영 찝찝하기도 하고 직원들이 늦게 퇴근하므로 그다음날 일에 까지 영향력을 미친 다는것도 달갑지 않은 상황입니다. 이런경우 어떻게 직원들한테 얘기를 해야 할지 궁금하고.. 또 저희가 여러 사업을 하면서 정부지원 사업을 받으면서 사업계획서등으로 기여를 한 직원이 있습니다. 개별적으로 보상을 해주고 싶은데..어떤 방법으로 하는게 나을지 저희는 보너스? 처럼 지급을 하려고 했는데...앞으로도 이와 비슷한 일을 많이 진행할 경우 직원에게 어떤 기대치를 주는게 아닌가 싶기도 하구요. 또한 작년까지는 인센티브를 전직원 동일하게 지급을 했는데..그또한 어떤 규정이나 차별화된 인센티브를 해야 할것 같은데.. 다른 대표님들은 어떻게 하는지 궁금합니다.