회사 소속이 달라지는 경우 연봉협상 어떻게 하나요?

올해 3월부터 회사를 다녔는데 같은 곳에서 같은 일을 하지만 학교 소속이었다가 회사 소속으로 변경이 된다고 합니다. 1년 이상 다닌게 아니라 퇴직연금도 사라진다 하고... 이렇거면 연봉협상을 하고 싶은데 연봉협상을 이번에 계약서 쓸 때하는게 맞을까요? 아니면 1년 됐을 때를 맞춰서 3월에 하는 게 맞을까요? 현재 연봉 4천만원 받고 있고 개발자로 일하고 있습니다. 개발자로 일한지는 약 1년 좀 넘었습니다. 계약서는 올해 12월까지 계약직으로 되어있습니다. 올리려면 4100~4200 정도로 올리고 싶은데 이게 적정한 연봉일지도 궁금합니다.